冒険の途中で襲い掛かってくる野生デジモンたち。バトルではリアルタイムに進行し、パートナーデジモンは自分で考え行動します。プレイヤーは司令塔となって自らの意思で行動するデジモンに指示を与えてサポートしていきます。バトルはリアルタイムで進行!バトルはリアルタイムで進行し、パートナーデジモンは装備したスキルを使い、自分で考えてバトルを行います。プレイヤーは下画面のコマンドアイコンで指示を出したり、アイテムを使用しサポートします。デジモンの「賢さ」や指示の出し方によって、出せる指示やバトル中にとる行動も変化していきます。必殺技とディフェンスどのデジモンも1つもっている、敵に強大なダメージを与える必殺技。戦闘中に「パワー」が溜まると必殺技が発動できます。「パワー」は敵に攻撃したり、ダメージを受けることでたまります。攻撃と防御は「アタックゲージ」とディフェンスゲージ」をタイミングよく押すことにより、ダメージが上下します。